高い網羅性

SomaScan Assayでは、約11,000のタンパク質ターゲットを一度に測定できます。JAK–STAT、PD-1/PD-L1、VEGF、PI3K–Akt、MAPKなど創薬で重視されるシグナル経路に加え、ケモカイン、TNF、細胞質DNAセンシング、AMPK、代謝経路など、免疫・炎症から薬剤応答、補償経路まで幅広くカバーします。既知の仮説に限定されず、生体反応をプロテオームレベルで俯瞰できます。

広いダイナミックレンジ

血中タンパク質の濃度は、主要な血漿タンパク質から微量なサイトカインまで、極めて広い範囲に分布しています。SomaScan Assayは、複数の希釈条件を組み合わせることで、fMレベルからµMレベルまで、約10桁に及ぶダイナミックレンジをカバーします。アルブミン除去などの枯渇処理を行うことなく、低濃度から高濃度までのタンパク質を一度のアッセイで捉えます。

高い再現性

CV(Coefficient of Variation、変動係数)は、アッセイ・測定系の再現性を示す指標です。SomaScan Assayの代表的なCVは約5%で、測定に伴う技術的な変動が低く抑えられています。群間差、治療前後、経時変化などを安定して比較でき、大規模コホートや多数の検体を扱う研究においても、一貫した測定と解析を支えます。

高い特異性

SomaScan Assayでは、各標的タンパク質に対して選定されたSOMAmer試薬を使用します。SOMAmerは、タンパク質の立体構造を認識し、高い親和性と特異性で結合する化学修飾DNAアプタマーです。複雑な血清・血漿などの試料中でも目的のタンパク質を選択的に捉えることで、多項目の一斉測定でありながら、個々の標的を識別する測定性能を実現します。

多様なサンプルに対応

SomaScan Assayは、ヒトの血清・血漿を中心に、髄液、細胞・組織由来試料、培養上清など、多様な研究試料に活用できます。さらに、マウスなどのモデル動物由来試料にも対応し、非臨床研究で得られた知見とヒト試料での検証を、同じプロテオミクス基盤でつなぐことができます。対応可否や必要量、前処理条件は、生物種、試料種、アッセイラインナップによって異なります。

Sample

  • 生物種、サンプルタイプやサンプル数など、研究の内容を伺いご提案をいたします。サンプルにより、必要量などが異なります。
  • お見積り、契約を経て、サンプルをご発送ください。
  • データ解析についてのご相談を承ります。
STEP
1

Data

  • SomaScan Assayによる測定データを納品いたします。
  • 主な納品物:発現データ(adat)、SQS(品質管理文書)
STEP
2

Analysis

  • RやPythonの解析パイプラインと合わせて、ブラウザで操作できる解析ツールもご用意があります
  • また、ご相談によって、目的に応じた解析・可視化を支援いたします。
STEP
3

プロテオミクス入門編

プロテオミクスって、結局何を見る技術?」から始めたい方へ。
ゲノム・トランスクリプトームとの違い、質量分析とアフィニティプロテオミクスの使い分け、創薬・疾患研究・予防医療への広がりまで、基礎から一気に俯瞰できます。

SomaScan Assay 早わかりガイド

SomaScanの強みを、短時間でまとめて把握したい方へ。
約11,000ターゲット、fMレベルから約10桁のダイナミックレンジ、CV約5%、対応サンプル、納品データまで、導入前に押さえたいポイントをコンパクトにまとめています。

プロテオミクス技術選択ガイド

「MS、抗体、アプタマー。結局どれを選べばいい?」に答えるためのガイドです。
各技術の得意・不得意を、探索性、感度、再現性、血清・血漿への適性などの観点から比較し、研究目的に合った選び方を整理しています。

SomaScan™ Assay の活用事例
創薬プロセス編

SomaScanは、創薬のどのフェーズで、どんな意思決定に使えるのか。
シーズ探索、非臨床、第I〜III相まで、各段階で「何を決めるか」「どんなデータが必要か」を、実際の研究事例とともに整理しています。

質問 サンプルはどのように準備したらよいですか?

回答「お問い合わせ」フォームよりお問い合わせください。お客様のサンプルに応じて、処理方法、送付方法を連絡させて頂きます。

質問 納期は何週間ですか?

回答 およそ1~2か月を想定しております。サンプル種、サンプル数、測定サービスによって納期は変わります。また、繁忙期(年度末)かそれ以外かも納期に影響します。詳細は「お問い合わせ」フォームより、お問い合わせください。

質問 生データだけでなく、解析までしてもらえるのでしょうか?

回答 解析サービスは測定サービスと異なります。測定サービスでは生データ「ADAT」のみがお客様に納品されます。解析サービスを希望されるお客様は別途お問い合わせください。

質問 解析サービスでは、機序の考察もしてもらえるのでしょうか?

回答 機序の考察は「解釈サービス」としており、これは「解析サービス」とは別です。解析サービスはデータの可視化(パスウエイ解析、ボルケーノプロット解析など)が目的であり、「解釈サービス」は関連論文調査、考察を目的とします。

質問 国内測定と海外測定では何が異なりますか?

回答 日本国内で測定できる検体種には限りがあり、日本国内で測定できないものは、海外(SomaLogic社)に測定を依頼します。この場合、海外への検体輸送費はお客様負担になりますのでご了承ください。海外に測定を依頼する場合も、日本のスタッフ(フォーネスライフ社)が対応させて頂きます。

質問 解析サービスを依頼した場合、追加の解析は無料で行って頂けますか?

回答 基本、追加の解析も有料で行っています。軽微な修正や追加については無料で行うこともございます。

信頼性保証体制はできていますか?

フォーネスライフではGCPに対応した体制を整えています。治験用(申請用)データとしてお客様データを最大10年間保管します。

過去に測定した結果と、今回測定した結果を比較することはできますか?

SomaScan®では以下の条件に限り、比較ができます。
①サンプルがヒトの血漿、またはヒトの血清であること
②同一の試薬ロットを使っていること
この条件を満たした場合、SomaScanではキャリブレーターによってプレート(バッチ)間の補正を行います。
ただし、補正は完全なものではありませんので、極力、同じ試験の検体は同じ時期に(ランダマイズして)測定することが望ましいです。
ヒトの血漿、血清以外の検体で、一つの試験を長期間にわたり測定する場合は、お客様の方で「ブリッジングサンプル」を準備頂く必要があります。
i-Ome™︎については、サンプル種に関わらず、お客様の方でブリッジングサンプルを準備頂く必要がございます。

検体返却はして頂けますか?

原則、検体返却は行わず、検体は当社にて廃棄させて頂いております。
しかしながら、非常に貴重な検体である場合に限り、検体返却に応じております。検体返却の費用はお客様にご負担頂いております。
検体返却が必要な場合はSSFにその旨記入し、担当営業に提出ください。

測定終了後の残検体を長期保管頂くことはできますか?

お客様が再測定する可能性がある場合に限り、長期保管に対応させて頂きます。長期保管に関しては担当営業に問い合わせください。

研究計画段階から、ご相談ください。

対象サンプル、検体数、研究デザイン、解析方法など、お気軽にお問い合わせください。